1，調整墊鐵和地腳螺栓具體主要是通過墊鐵和地腳螺栓進行調整機床的幾何精度，必要時也可以通過稍微改變導軌上的鑲條和預緊滾輪來達到精度要求。
2，調整機械手與主軸、刀具庫之間相對位置，使機床自動運行到換刀位置，用手動方式分步完成刀具交換動作，檢查抓刀、裝刀、拔刀、旋轉交換等動作是否準確平穩。
3，調整托板與交換工作臺面的相對位置該種機床是雙工作臺或多工作臺，要調整好工作臺托板與交換工作臺面的相對位置，以保證工作臺自動交換時平穩可靠。
三坐標數控深孔鉆床的應用范圍主要有以下3個方面：
1，通用機床上不易加工，或需要在通用機床上配置復雜專用夾具且需很長調整時間才能加工的零件；
2，需要小批量多批次生產（一般在100件以下）的零件，輪廓形狀復雜、加工精度要求較高或必須用數字方法解決的復雜曲線、曲面的模具類零件，準備多次改型設計的零件；
3，需要進行鏜、銑、鉆、擴、鉸、锪、攻螺紋等多工序聯合加工并一次裝夾可完成的零件，價值甚高的精密型零件。